1916年6月6日，妄圖復(fù)辟帝制的袁世凱在全國人民的怒斥聲中憂懼病死。次日，黎元洪繼任大總統(tǒng)，6月29日他宣布遵行孫中山在南京臨時政府時期制定的《臨時約法》，恢復(fù)國會，并由段祺瑞出任國務(wù)總理。面對新的政治形勢，孫中山及時作出決斷。

　　護(hù)法旗幟

　　經(jīng)過民國初年風(fēng)云變幻的政治斗爭的磨煉，孫中山的政治眼光更為深邃。正如他自己所說：“由于對人性有更深之理解，兼得以往經(jīng)驗之助，我們應(yīng)付各種事務(wù)之才智已大有長進(jìn)”（《孫中山全集》第3卷，第231頁）。當(dāng)袁世凱被迫宣布撤銷帝制后，孫中山就曾告誡人們，斗爭的目標(biāo)不能僅著眼于袁世凱一人的去留。5月9日，孫中山在《討袁宣言》中明確指出：“保持民國，不徒以去袁為畢事”，表示“袁氏未去，當(dāng)與國民共任討賊之事；袁氏既去，當(dāng)與國民共荷監(jiān)督之責(zé)，決不肯使謀危民國者復(fù)生于國內(nèi)”。他清醒地認(rèn)識到，國內(nèi)的反動勢力必不會隨著袁世凱的死去而告消亡，維護(hù)共和制度的斗爭還將是艱巨的。

　　但是另一方面，孫中山在反袁斗爭中，一直是以維護(hù)約法為號召的。護(hù)國戰(zhàn)爭開始后，他又強調(diào)：“約法與國會，共和國之命脈也”（同上，第281頁）。黎元洪上任后，宣布遵行約法，恢復(fù)國會。袁世凱死后，人們的注意力又普遍轉(zhuǎn)向平息動亂。在這種情況下，孫中山不能不下令停止中華革命黨的軍事行動。接著，中華革命黨本部又奉孫中山的指示，宣布停止一切黨務(wù)活動。不能把孫中山這時的政治態(tài)度，簡單地看成是他在民國初年“讓位”后，專注實業(yè)建設(shè)經(jīng)歷的重復(fù)。孫中山拒絕重新?lián)沃腥A民國鐵道協(xié)會會長，就是一個例證。護(hù)國運動結(jié)束后，他在各地發(fā)表的一系列演說，更是清楚地說明了這一點。

　　7月15日，孫中山出席駐滬粵籍議員茶話會，強調(diào)維護(hù)民主共和與爭取國民支持的關(guān)系：“欲民國之鞏固，必先建其基礎(chǔ)。基礎(chǔ)不必外求，當(dāng)求諸全國國民心中”（同上，第323頁）。7月17日，孫中山在張園向在滬參、眾兩院議員及各界名流、新聞記者發(fā)表演說，闡述地方自治、直接民權(quán)等問題。與此同時，孫中山?jīng)]有放松對國內(nèi)反動勢力的防范和警惕。他在與胡漢民談話時，明確指出：“北京當(dāng)局現(xiàn)勾結(jié)帝國主義者有解散國會的意思，對于國家有搗亂的行為，我便要討伐他們”（《孫中山年譜長編》，第1010頁）。這些都充分說明，孫中山對當(dāng)時政治斗爭的形勢，是有深刻認(rèn)識的。正因為有這樣的思想基礎(chǔ)，段祺瑞、張勛等人破壞共和的活動，自始就遭到孫中山的堅決抵制。

　　護(hù)國運動結(jié)束后，孫中山在各地講演的一個主題，是闡述通過實行地方自治、直接民權(quán)等途徑，穩(wěn)固民主共和制度的基礎(chǔ)。1917年2月，他在上海完成《會議通則》(后改名《民權(quán)初步》)一書，同年4月由上海中華書局出版發(fā)行。孫中山在自序中寫道，撰寫該書的目的，在于“教吾國人行民權(quán)第一步之方法。”他認(rèn)為：“今后民國前途之安危若何，則全視民權(quán)之發(fā)達(dá)如何耳。”孫中山在書中，較詳細(xì)地闡述了西方國家民主制度有關(guān)會議的各項細(xì)則。雖然西方民主制度在半殖民地半封建的中國不可能得到推行，孫中山注意介紹民主制度的有關(guān)知識，希望通過鼓勵國民的參政意識，加強民主制度的建設(shè)，應(yīng)該說是有其積極意義的。

　　黃興病逝

　　在反對帝制復(fù)辟，維護(hù)共和制度的斗爭中，一度因黃興不同意按手印加入中華革命黨的程序，孫中山與黃興之間存在的隔閡逐漸消除。中華革命黨成立前夕，黃興雖然遠(yuǎn)走美國，但祖國的危難仍無時無刻不在他心中縈繞。孫中山也一直惦記著他。1915年3月，孫中山致信黃興說：“中國當(dāng)此外患侵逼、內(nèi)政紊亂之秋，正我輩奮戈飲彈、碎肉喋血之時。公革命之健者，正宜同心一致，乘機以起”。坦率地希望黃興“即日言旋”，攜手奮斗（《孫中山全集》第3卷，第166—167頁）。

　　籌安會登臺后，袁世凱稱帝的野心昭然若揭，黃興遣長子黃一歐向?qū)O中山面交信函，認(rèn)為袁將帝制自為，發(fā)難機會已到，如有所命，亟愿效力。孫中山再次表示希望黃興早日去日本，共商反袁事宜。1916年5月，黃興從美國抵達(dá)日本。這時，孫中山已返回國內(nèi)。他在上海致函黃興，希望黃興協(xié)助向日本“借購軍械之事”。并真切地說：“兄與弟有十余年最深關(guān)系之歷史，未嘗一日相迕之感情，弟信兄愛我助我，無殊曩日”；“事有把握，仍企來滬一行，共商進(jìn)行各事”（同上，第290頁）。

　　袁世凱死后，孫中山與黃興之間，曾就革命黨人對時局的態(tài)度，切磋商討，互相配合。同年7月，黃興從日本回到上海，兩人交往密切，商談國是，一如往昔。10月，黃興病危，孫中山去寓所看望。黃興病逝后，孫中山通告中華革命黨各支分部，沉痛悼念，并高度評價了黃興對革命事業(yè)的卓越貢獻(xiàn)：“黃克強先生自創(chuàng)同盟會以來，與文共事，奔走艱難，迄于今日，凡我同志諒均知悉”；“遽此凋謝，為國為友，悼傷百端”（同上，第384頁）。黃興的逝世，對中國資產(chǎn)階級民主革命，不啻是一個很大的損失。在以后的革命斗爭中，孫中山失去了一位有力的支持者。

　　府院之爭

　　1916年袁世凱死后，孫中山在中國恢復(fù)民主共和制度的設(shè)想，并沒有得到實現(xiàn)。把持北京政權(quán)的以段祺瑞為首的北洋軍閥，繼承袁世凱的衣缽，大搞專制獨裁。當(dāng)時，第一次世界大戰(zhàn)尚在進(jìn)行。段祺瑞企圖通過“參戰(zhàn)”，取得日本更多的貸款和軍火，擴充自己的勢力。得到國會支持的黎元洪，則反對參戰(zhàn)，于是便發(fā)生了“府院之爭”。這場爭執(zhí)，反映了帝國主義列強之間的矛盾和斗爭。日本企圖通過支持段祺瑞參戰(zhàn)，加強它在中國的控制，英、美等國則不愿意看到日本在華勢力的進(jìn)一步擴張。正是在這樣的背景下，“府院之爭”愈演愈烈。

　　1917年5月，段祺瑞唆使軍警、流氓數(shù)千人組成所謂“公民請愿團(tuán)”，脅迫國會通過對德宣戰(zhàn)案，遭到國會的拒絕。黎元洪遂在美國公使允為后盾的情況下，罷免了段祺瑞的總理職務(wù)，由伍廷芳暫時代理。段遂出走天津，指使各省軍閥紛紛宣布脫離中央，并在天津設(shè)立獨立各省總參謀部，揚言要以武力倒黎。屯兵徐州、居心叵測的張勛，乘機向黎元洪提出愿居間調(diào)停。

　　6月，張勛受黎元洪之邀，率三千辮子兵入京。途經(jīng)天津時，在段祺瑞的暗中支持下，于6月12日撕下調(diào)停的偽裝，以武力脅迫黎元洪解散了國會。入京后，又在7月1日公然擁戴溥儀復(fù)辟帝制。消息傳出，遭到全國人民的同聲譴責(zé)。段祺瑞看到借張勛之力，驅(qū)逐黎元洪、解散國會的計謀已經(jīng)得逞，便于7月2日在天津宣布討伐張勛，自任“討逆軍”總司令。

　　7月12日，“討逆軍”開入北京，張勛躲進(jìn)荷蘭使館，溥儀再次宣布退位，復(fù)辟丑劇開場12天即告破產(chǎn)。段祺瑞重新把持北京政權(quán)后，公開揚言“一不要約法，二不要國會，三不要舊總統(tǒng)” （《民國大新聞報》，1917年7月22日）。繼續(xù)投靠日本帝國主義，大舉借債，擴充兵力，企圖實現(xiàn)“武力統(tǒng)一”，建立起專制獨裁統(tǒng)治。

　　聯(lián)絡(luò)海軍

　　孫中山目睹護(hù)國運動結(jié)束后軍閥、政客紛爭不已，共和制度形同虛設(shè)，反動勢力日益猖獗，國家一天不如一天，內(nèi)心十分激憤。當(dāng)“府院之爭”白熱化，張勛以調(diào)停為名，率兵北上時，孫中山敏銳地看到了復(fù)辟陰云的迫近，決定采取切實措施，予以抵制。他致電唐繼堯，希望唐團(tuán)結(jié)西南力量，出師護(hù)法。接著，孫中山又致電粵、滇、黔、川、桂、湘各省都督、省長，指出“民國與叛逆不能兩存，擁護(hù)民國與調(diào)和不可兼得”，希望他們“克日誓師，救此危局，作民保障”（《孫中山全集》第4卷，第102頁）。

　　但西南地區(qū)的這些實力人物，對孫中山的呼吁，反應(yīng)冷淡。這時，北京政局進(jìn)一步惡化，國會被迫解散。6月14日，胡漢民受孫中山派遣，赴粵聯(lián)絡(luò)護(hù)法力量，得到想借護(hù)法之名，保持地盤，擴充實力的西南軍閥表面上的贊同。孫中山則在上海通過程璧光，積極爭取海軍的支持。

　　程璧光曾參加過興中會廣州分會，早年畢業(yè)于福州水師學(xué)堂，在海軍中聲望較高，時任北京政府海軍總長。在黎段爭斗中，他站在黎元洪一邊，段祺瑞被免職后，在天津集結(jié)力量，以武力威脅北京。程璧光奉黎元洪之命，離京赴滬巡視海軍，以保證海軍擁黎反段。孫中山這時“深深覺得沒有武裝力量，不足以與北洋軍閥對抗斗爭，無由貫徹救國救民的宗旨。所以他幾次與當(dāng)時在上海的海軍總長程璧光磋商，希望海軍也參加護(hù)法的行列”（《辛亥革命回憶錄》第1集，第27頁）。6月23日，孫中山主動約見程璧光會商大計。7月1日，張勛策動的帝制復(fù)辟丑劇開場，孫中山于3日再邀程璧光等人會商，決定通電全國，南下護(hù)法，討伐叛逆。